Ферментативная CLICK-функционализация ДНК

+7(499)397-01-09 Корзина

Каталог > Реактивы > Виды реактивов > Клик-химия > Клик-химия по назначению > Клик-химия для ДНК >
Ферментативная CLICK-функционализация ДНК ... on DNA - Enzymatic CLICK-functionalization of DNA

Реакционные "CLICK"-группы такие как азиды, алкины или DBCO ферментативно встроены в ДНК/кДНК через соответствующие модифицированные нуклеотиды , включенные вместо их натуральных аналогов (Таблица 1). Для обеспечения оптимальных свойств субстрата, основная структура наших модифицированных нуклеотидов получается из натуральных аналогов с желаемой реакционной группой, присоединенной через оптимизированный линкер в одной из благоприятных нуклеотидных позиций(цитидин/уридин:C-5 положение).

Получившаяся CLICK-функционализированная ДНК может впоследствии быть обработана в Cu(I)-катализируемой (азид-алкин) или свободной от меди (азид-DBCO) клик-реакции, дающей возможность:

внедрить Биотиновую группу для последующего очищения (Азиды Биотина, Алкины Биотина или DBCO-содержащие биотинилирующие реагенты)
внедрить флюоресцентную группу для последующей визуализации и микроскопирования (via флюоресцентные Азиды, флюоресцентные Алкины или DBCO-содержащие флюоресцентные красители)
связать ДНК с комплементарными CLICK-функционализированными биомолекулами, например, белками

Таблица 1 Ферментативное встраивание Азид- / DBCO - / Алкин-модифицированных нуклеотидов.

ПЦР: Полимеразная цепная реакция с Taq полимеразой (CLK-T09, NU-1705) или полимеразами семейства B Pwo, Deep Vent exo^- и KOD XL (CLK-T05/-T06/-T07);
NT: Ник-трансляция с ДНКазой I / ДНК-полимеразой I;
Элонгация праймера: Удлинение праймера полимеразами семейства B Pwo, Deep Vent exo^- и KOD XL;
3'-концевое мечение: включение Терминальной деоксинуклеотидил Трансферазой (TdT);
RT:: Обратная транскрипция с обратной транскриптазой вируса мышиного лейкоза Молони (MMLV RT)

¹: собственное тестирование

²: внешние данные (см. руководство)

n/a: нет информации

- : неприменимо

		ДНК-мечение				кДНК мечение
Нуклеотид	Cat. No.	ПЦР	NT	Элонгация праймера	3’ концевое мечение	RT
dUTP
5-DBCO-dUTP	CLK-T09	x¹	n/a	n/a	n/a	n/a
Азид-PEG4-Аминоаллил-dUTP	NU-1705	x¹	n/a	n/a	x²	n/a
5-Этинил-dUTP	CLK-T07	x^1,2	n/a	x²	n/a	n/a
C8-Алкин-dUTP	CLK-T05	x^1,2	n/a	x²	n/a	n/a
5-TCO-PEG₄-dUTP	CLK-035	x¹	n/a	n/a	n/a	n/a
5-Винил-dUTP	CLK-068	x¹	n/a	n/a	n/a	n/a
dCTP
C8-Алкин-dCTP	CLK-T06	x^1,2	n/a	x²	x²	n/a
5-DBCO-PEG4-dCTP	CLK-T06	x¹	n/a	n/a	n/a	n/a
5-Азидо-PEG4-dCTP	CLK-T06	x¹	n/a	n/a	n/a	n/a
dATP
N⁶-Азидогексил-dATP	CLK-NU-002	x¹	n/a	n/a	n/a	n/a

Кроме того, доступны другие Азид-модифицированные, Алкин-модифицированные или DBCO-модифицированные нуклеотиды

5-Azido-PEG4-dCTP

Название	Код	Цена	Количество
5-Azido-PEG4-dCTP, 5 x 50 μl	CLK-070L	по запросу	5 x 50 μl (10 mM)
5-Azido-PEG4-dCTP, 50 μl	CLK-070S	по запросу	50 μl (10 mM)

5-DBCO-PEG4-dCTP

Название	Код	Цена	Количество
5-DBCO-PEG4-dCTP, 5 x 50 μl	CLK-060L	по запросу	5 x 50 μl (10 mM)
5-DBCO-PEG4-dCTP, 50 μl	CLK-060S	по запросу	50 μl (10 mM)

5-DBCO-PEG4-dUTP

Название	Код	Цена	Количество
5-DBCO-PEG4-dUTP, 5 x 50 μl	CLK-048-L	по запросу	5 x 50 μl (10 mM)
5-DBCO-PEG4-dUTP, 50 μl	CLK-048-S	по запросу	50 μl (10 mM)

5-Ethynyl-dUTP (5-EdUTP)

Datasheet

Название	Код	Цена	Количество
5-Ethynyl-dUTP (5-EdUTP)	CLK-T07-XL	по запросу	50 μl (100 mM)
L pack	CLK-T07-L	по запросу	5 µmol
S pack	CLK-T07-S	по запросу	0,5 µmol

5-TCO-PEG4-dUTP

Название	Код	Цена	Количество
5-TCO-PEG4-dUTP, 200 μl	CLK-035S	по запросу	200 μl (1 mM)
5-TCO-PEG4-dUTP, 5 x 200 μl	CLK-035L	по запросу	5 x 200 μl (1 mM)

5-TCO-PEG₄-dUTP

Datasheet

Название	Код	Цена	Количество
L pack	CLK-035L	по запросу	5 x 200 µl (1 mM)
S pack	CLK-035S	по запросу	200 µl (1 mM)

Azide-PEG4-aminoallyl-dUTP

Datasheet

Название	Код	Цена	Количество
L pack	NU-1705L	по запросу	5 x 50 Units
S pack	NU-1705S	по запросу	50 Units

C8-Alkyne-dCTP

Datasheet

Название	Код	Цена	Количество
C8-Alkyne-dCTP	CLK-T06-XL	по запросу	50 μl (100 mM)
L pack	CLK-T06-L	по запросу	5 µmol
S pack	CLK-T06-S	по запросу	0,5 µmol

C8-Alkyne-dUTP

Datasheet

Название	Код	Цена	Количество
C8-Alkyne-dUTP	CLK-T05-XL	по запросу	50 μl (100 mM)
L pack	CLK-T05-L	по запросу	50 µl (100 mM)
S pack	CLK-T05-S	по запросу	5 µl (100 mM)

ДНК

Информация представлена исключительно в ознакомительных целях и ни при каких условиях не является публичной офертой