1. Каталог >
  2. Реактивы >
  3. Виды реактивов >
  4. Нуклеозиды, Нуклеотиды и их аналоги >
  5. Нуклеотиды >
  6. Нуклеотиды по структуре >
  7. Основные структурные классы >
  8. Немодифицированные и Модифицированные ddNTP (дидеоксинуклеотидтрифосфаты) >

Немодифицированные ddNTP для секвенирования и SNP генотипирования

Nucleotides by Structure  /  Important Structure Motifs  /  Unmodified and Modified ddNTPs - Unmodified ddNTPs for Sequencing & SNP Genotyping

У дидеоксинуклеотид трифосфатов (ddNTP) отсутствует 3'-OH группа, которая необходима для удлинения цепи посредством полимеразы в ПЦР. Таким образом, ddNTP используются в сочетании с модифицированной Taq-полимеразой (например, JBS сиквенсовой полимеразой или Thermosequenase™) как 3'-концевые терминаторы в секвенировании по Сенгеру[1] (Fig. 1) генотипировании однонуклеотидного полиморфизма (SNP) по элонгации праймера (SBE)[2] (Fig. 2). Степень очистки ddNTP составляет > 98 % (ВЭЖХ), они функционально испытаны для терминации цепи при сиквенсе.

Сиквенсовая полимеразаdNTPs5'-флуоресцентно меченый праймерМетод секвенирования Сэнгера
Figure 1: Ферментативный метод секвенирования Сэнгера с дидеокси- обрывом цепи [1] основан на линейной амплификации одноцепочечной матричной ДНК с использованием 5'-флуоресцентно меченого праймера и модифицированной Taq полимеразы. Синтез комплементарной ДНК-цепи начинается на специфическом праймер-сайте и заканчивается включением обрывающего цепочку ddNTP, который случайным образом введен вместо соответсвующего dNTP. При использовании четырех разных ddNTP в четырех отдельных реакционных пробирках, получается набор цепей удлиненных праймеров, терминированных в каждой позиции A, C, G и T. Когда эти фрагменты разделены на подходящей гелевой матрице, последовательность ДНК определяется по порядку смещения полос (снизу вверх).

Вы также можете ознакомиться с нашими Наборами для секвенирования

Сиквенсовая полимеразаPrimerГенотипирование однонуклеотидного полиморфизма по элонгации праймера
Figure 2: Одиночное удлинение праймера(SBE) - надежный метод для детекции однонуклеотидного полиморфизма в a priori известной позиции[2]. Он основан на удлинении праймера, подобранного чтобы связываться на один нуклеотид раньше полиморфного, соответствующим ddNTP. Последующая детекция встроенных ddNTP проводится с помощью масс-спектрометрии удлиненных праймеров is performed by mass spectrometry of the extended primer, таким образом выявляя нуклеотидное основание в этой позиции на матричной цепи.[3].
Datasheet
НазваниеКодЦена Количество
L pack NU-1015L по запросу 5 x 100 µl
(5 µmol)
S pack NU-1015S по запросу 100 µl
(1 µmol)
Store at -20°C, short term (up to one week) exposure
to ambient temperature possible
Aqueous solution of ultrapure, sequencing grade ddATP.



Datasheet
НазваниеКодЦена Количество
L pack NU-1016L по запросу 5 x 100 µl
(5 µmol)
S pack NU-1016S по запросу 100 µl
(1 µmol)
Store at -20°C, short term (up to one week) exposure
to ambient temperature possible
Aqueous solution of ultrapure, sequencing grade ddCTP.



Datasheet
НазваниеКодЦена Количество
L pack NU-1017L по запросу 5 x 100 µl
(5 µmol)
S pack NU-1017S по запросу 100 µl
(1 µmol)
Store at -20°C, short term (up to one week) exposure
to ambient temperature possible
Aqueous solution of ultrapure, sequencing grade ddGTP.



Datasheet
НазваниеКодЦена Количество
L pack NU-1018L по запросу 5 x 100 µl
(5 µmol)
S pack NU-1018S по запросу 100 µl
(1 µmol)
Store at -20°C, short term (up to one week) exposure
to ambient temperature possible
Aqueous solution of ultrapure, sequencing grade ddTTP.




Информация представлена исключительно в ознакомительных целях и ни при каких условиях не является публичной офертой