Однонуклеотидные полиморфизмы (SNPs) - мутации одной пары оснований в конкретном расположении в кодирующем или некодирующем районе генома, которые имеются более чем у 1% популяции. [1]. В то время как SNP, располагающиеся в кодирующем районе могут изменять биологическую функцию белка, SNP присутствующие в некодирующем регионе могут служить для генной регуляции. И кодирующие и некодирующие SNP связаны с популяционно-специфическим развитием заболеваний и восприимчивостью к лекарствам и и потому используются как маркеры в генетике заблоеваний и фармакогенетических исследованиях[2].
Эффективным и надежным подходом к генотипированию SNP с известным расположением является метод добавление динуклеотида(SBE - single basepair extension )[3,4,5]. Этот метод основан на удлинении праймера, способного связываться на один нуклеотид выше полиморфного локуса, SNP-комплементарным флуоресцентно меченым ddNTP[5]. Последующая детекция встроенного ddNTP обеспечивается флуоресцентной визуализацией увеличенного праймера в электрофорезе или в планшетах, выявляя таким образом нуклеотидное основания в заданной позиции на исследуемой матрице.
Figure 1: Детекция однонуклеотидного полиморфизма (SNP) ферментативной элонгацией праймера SNP-комплементарным флуоресцентно меченым динуклеотидом. Праймер подобран, чтобы связываться одним нуклеотидом выше полиморфного сайта. Последующая флуоресцентная визуализация продукта показывает встроенный нуклеотид и, следовательно, SNP генотип.
[1] Brookes et al. (1999) The essence of SNPs. Gene 234:177.
[2] Kim et al. (2007) SNP genotyping: technologies and biomedical applications. Annual review of Biomedical Engineering 9:289.
[3] Desphande et al. (2005) Multiplexed SNP Genotyping using single-base extension (SBE) and microsphere arrays. Current protocols in Cytometry 13 (4):1.
[4] Syvänen et al. (1999) From gels to chips: Minisequencing primer extension for analysis of point mutations and single nucleotide polymorphisms. Hum. Mut. 13:10.
[5] Esteves et al. (2011) Clinical relevance of multiple single-nucleotide polymorphisms in Pneumocystis jirovecii Pneumonia: development of a multiplex PCR-single-base-extension methodology. J. Clin. Microbiol. 49 (5):1810.
|
|
| Название | Код | Цена |
Количество |
| 1 mg pack |
NU-850-1 |
по запросу |
1 mg |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
| Название | Код | Цена |
Количество |
| 1 mg pack |
NU-1619-1 |
по запросу |
1 mg |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
| Название | Код | Цена |
Количество |
| 1 mg pack |
NU-1618-1 |
по запросу |
1 mg |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
| Название | Код | Цена |
Количество |
| 1 mg pack |
NU-1612-1 |
по запросу |
1 mg |
|
|
|
|
|
|
|
Информация представлена исключительно в ознакомительных целях и ни при каких условиях не является публичной офертой
Datasheet
