Набор реактивов PP-214 предназначен для выделения из бактерий геномной ДНК, подходящей для различных применений, в том числе для ПЦР в реальном времени, Саузерн-блот анализ, генотипирование и открытие или проверка SNP/SSR маркеров.
Метод выделения основан на адсорбции ДНК на силикагелевой мембране в центрифужных колонках. Это позволяет полностью удалить ингибиторы ПЦР - такие, как бивалентные катионы и белки, получая в результате геномную ДНК высокой степени очистки.
В данном методе выделения ДНК не используется фенол или хлороформ, благодаря чему обращение с набором безопасно, а также не образуется вредных отходов. Набор для выделения ДНК в колонках позволяет получать выход до 30 µg ДНК на выделение, размер молекул от 200 bp до 50 kb.
Название |
Код |
Цена |
Количество |
|
L pack |
PP-214L |
по запросу |
250 preparations |
|
Технические параметры | |
Количество | 250 preparations |
|
S pack |
PP-214S |
по запросу |
50 preparations |
|
Технические параметры | |
Количество | 50 preparations |
|
Sample |
PP-214XS |
по запросу |
10 preparations |
|
Технические параметры | |
Количество | 10 preparations |
|
Дополнительно понадобится (не входит в комплект):
- 96-99% этанол
- Бидистиллированная вода
- Пробирки 1,5 - 2 мл.
Предварительные процедуры:
Перед началом необходимо разбавить некоторые реактивы
бидистиллированной водой, либо
96-99% этанолом согласно приведенной ниже таблице.
Состав набора
|
PP-214XS (10 проб) |
PP-214S (50 проб) |
PP-214L (250 проб) |
Буфер для ресуспендирования |
3.2 мл. |
16 мл. |
80 мл. |
Буфер для лизиса |
3.2 мл. |
16 мл. |
80 мл. |
Буфер для связывания |
3.2 мл. |
16 мл. |
80 мл. |
РНКаза A |
1.5 мг (добавить 30 µl воды) |
7.5 мг (добавить 150 µl воды) |
5x 7.5 мг (добавить 150 µl воды к каждой пробирке) |
Лизоцим |
2.5 мг (добавить 25 µl воды) |
12.5 мг (добавить 125 µl воды) |
5x 12.5 мг (добавить 125 µl воды к каждой пробирке) |
Протеиназа K |
1 мг (добавить 100 µl воды) |
5 мг (добавить 500 µl воды) |
5x 5 мг (добавить 500 µl воды к каждой пробирке) |
Буфер для активации |
1.2 мл. |
6 мл. |
30 мл. |
Отмывочный буфер |
добавить 9.6 мл этанола до итогового объема 12 мл. |
добавить 48 мл этанола до итогового объема 60 мл. |
добавить в каждую бутыль 120 мл этанола до итогового объема 150 мл. |
Элюционный буфер |
1 мл. |
5 мл. |
25 мл. |
Прочее |
Спин-колонки, Коллекторные пробирки 2 мл.
|
Важно использовать правильное количество исходного материала для того, чтобы получить оптимальный выход и степень очистки ДНК. В одной пробе может быть обработано до 10
8 бактериальных клеток. Клеточный осадок может храниться при температуре -70°C в течение нескольких месяцев.
Выделение ДНК из бактерий (грам-положительных и грам-отрицательных)
-
Клеточное ресуспендирование
- Соберите 500 мкл культивируемых клеток бактерий центрифугированием при 10 000хg в течение 1 минуты
- Удалите надосадочную жидкость
- При выделении ДНК из грам-положительных бактерий:
- Ресуспендируйте клеточную массу в 300 мкл буфера для ресуспендирования
- Добавьте 2 µl раствора Лизоцима
- Хорошо перемешайте, переворачивая пробирку несколько раз
- Инкубируйте в течение 1 минуты при 37°С
- Центрифугируйте в течение 1 минуты при 10 000хg
- Удалите надосадочную жидкость
-
Клеточный лизис
- Добавьте 300 µl буфера для лизиса и 2 µl РНКазы А в клеточную массу
- Энергично перемешайте на вортексе в течение 30-60 сек
- Добавьте 8 µl Протеиназы К и перемешайте пипетированием
- Инкубируйте в течение 10 минут при 60°С и остужайте в течение 5 минут
- Добавьте 300 µl буфера для связывания и немного перемешайте на вортексе
- Поместите пробирку на лед на 5 минут
- Центрифугируйте в течение 5 минут при 10 000 g
-
Активация колонки (опционально):
- Поместите спин-колонку в 2 мл пробирку для образцов
- Добавьте 100 µl буфера для активации в спин-колонку
- Центрифугируйте в течение 30 сек при 10 000 g и сразу же переходите к следующему шагу
- Удалите фильтрат
-
Загрузка колонок:
- Поместите спин-колонку в 2 мл пробирку для образцов (если этого не было сделано ранее)
- Накапайте надосадочную жидкость прямо в спин-колонку
- Центрифугируйте в течение 1 минуты при 10 000 g
- Удалите фильтрат
-
Первичная отмывка:
- Добавьте 500 µl отмывочного буфера в спин-колонку
- Центрифугируйте в течение 30 секунд при 10 000 g
- Удалите фильтрат
-
Вторичная отмывка:
- Добавьте 500 µl отмывочного буфера в спин-колонку
- Центрифугируйте в течение 30 секунд при 10 000 g
- Удалите фильтрат
- Еще раз центрифугируйте в течение 1 минуты при 10 000 g, чтобы удалить остатки отмывочного буфера
- Удалите 2 мл отмывочную пробирку и поместите колонку в пробирку для выделения
-
Выделение ДНК:
- Добавьте 40-50 µl элюционного буфера в центр колонки
- Инкубируйте при комнатной температуре в течение 1 минуты
- Центрифугируйте в течение 2 минут при 10 000 g
- Храните ДНК при 4°С или -20°С
Информация представлена исключительно в ознакомительных целях и ни при каких условиях не является публичной офертой