Набор реагентов
PP-215 предназначен для выделения из дрожжевых клеток тотальной ДНК, пригодной для различных применений, включая ПЦР в реальном времени, блоттинг по Саузерену, генотипирование и открытие или верификация SNP/SSR маркеров.
Механизм выделения днк базируется на адсорбции ДНК на силикагелевой мембране в центрифужных колонках. Это позволяет полностью ликвидировать ингибиторы ПЦР - такие, как, двухвалентные катионы и белки, получая в результате геномную ДНК высокой степени очистки.
В данном методе выделения ДНК не применяется фенол или хлороформ, благодаря чему работа с набором безопасна, а также не образуется вредных отходов. Набор для выделения ДНК в колонках позволяет получать выход до 30 µg ДНК на выделение, размер молекул от 200 bp до 50 kb.
Название |
Код |
Цена |
Количество |
|
L pack |
PP-215L |
по запросу |
250 preparations |
|
Технические параметры | |
Количество | 250 preparations |
|
S pack |
PP-215S |
по запросу |
50 preparations |
|
Технические параметры | |
Количество | 50 preparations |
|
Sample |
PP-215XS |
по запросу |
10 preparations |
|
Технические параметры | |
Количество | 10 preparations |
|
Дополнительно понадобится (не поставляется в комплекте):
- 96-99% этиловый спирт
- Бидистиллированная вода
- Пробирки 1,5 - 2 мл.
Предварительные процедуры:
Перед началом необходимо разбавить некоторые реактивы
бидистиллированной водой,
96-99% этиловым спиртом или смешать между собой согласно приведенной далее таблице:
Состав набора
|
PP-215XS (10 проб) |
PP-215S (50 проб) |
PP-215L (250 проб) |
Буфер для ресуспендирования |
3.2 мл. |
16 мл. |
80 мл. |
Литиказа (2.5 units/мкл)) |
35 units (добавить 14 мкл буфера литиказы) |
175 units (добавить 70 мкл буфера литиказы) |
5 x 175 units (добавить 70 мкл буфера литиказы в каждую пробирку) |
Буфер литиказы |
14 мкл |
70 мкл |
350 мкл |
Буфер для лизиса |
3.2 мл. |
16 мл. |
80 мл. |
Буфер для связывания |
3.2 мл. |
16 мл. |
80 мл. |
РНКаза A |
1.5 мг (добавить 30 µl воды) |
7.5 мг (добавить 150 µl воды) |
5x 7.5 мг (добавить 150 µl воды к каждой пробирке) |
Протеиназа K |
1 мг (добавить 100 µl воды) |
5 мг (добавить 500 µl воды) |
5x 5 мг(добавить 500 µl воды к каждой пробирке) |
Буфер для активации |
1.2 мл. |
6 мл. |
30 мл. |
Отмывочный буфер |
добавить 9.6 мл этанола до итогового объема 12 мл. |
добавить 48 мл этанола до итогового объема 60 мл. |
добавить в каждую бутыль 120 мл этанола до итогового объема 150 мл. |
Элюционный буфер |
1 мл. |
5 мл. |
25 мл. |
Важно использовать верное количество анализируемого образца для того, чтобы получить оптимальный выход и степень очистки ДНК. В одной пробе может быть обработано до 1 - 2 x 10
7 дрожжевых клеток. Клеточный осадок может храниться замороженным при -70°C в течение нескольких месяцев.
Выделение ДНК из дрожжей
-
Ресуспендирование и лизис клеток дрожжей
- Осадите 500 мкл культивируемых дрожжевых клеток центрифугированием при 8 000 g в течение 1 минуты
- Удалите надосадочную жидкость и немедленно приступайте к следующему шагу
- Внесите 100 µl буфера для ресуспендирования и 1 µl Литиказы в клеточный осадок
- Интенсивно встряхните на вортексе 10 сек
- Выдерживайте 15 минут при 37°С
- Центрифугируйте в течение 1 минуты при 10 000 g
- Удалите супернатант
- Добавьте 300 µl буфера для лизиса и 2 µl РНКазы А в клеточный осадок
- Энергично перемешайте на вортексе 10 сек
- Добавьте 8 µl Протеиназы К и пипетируйте для перемешивания
- Инкубируйте 10 минут при 60°С и остужайте на льду 5 минут
- Добавьте 300 µl буфера для связывания и немного встряхните на вортексе
- Поместите пробирку на лед на 5 минут
- Центрифугируйте 5 минут при 10 000 g
-
Активация колонки (опционально):
- Поместите спин-колонку в 2 мл пробирку для образцов
- Внесите 100 µl буфера для активации в спин-колонку
- Центрифугируйте в течение 30 секунд при 10 000 g и сразу же следуйте к следующему пункту
- Удалите фильтрат
-
Загрузка колонок:
- Вставьте спин-колонку в 2 мл пробирку для образцов (если этого не было сделано на предыдущем этапе)
- Поместите надосадочную жидкость(лизат) прямо в спин-колонку
- Центрифугируйте 1 мин при 10 000 g
- Удалите фильтрат
-
Первичная отмывка:
- Внесите 500 µl отмывочного буфера в спин-колонку
- Центрифугируйте в течение 30 секунд при 10 000 g
- Удалите фильтрат
-
Вторичная отмывка:
- Добавьте 500 µl отмывочного буфера в спин-колонку
- Центрифугируйте 30 сек при 10 000 g
- Удалите отфильтровавшуюся жидкость
- Еще раз центрифугируйте 1 минуту при 10 000 g, чтобы удалить остатки отмывочного буфера
- Удалите 2 мл отмывочную пробирку и вставьте колонку в пробирку для выделения
-
Выделение ДНК:
- Добавьте 40-50 µl элюционного буфера в центр колонки
- Выдерживайте при комнатной температуре в течение 1 минуты
- Центрифугируйте 2 минуту при 10 000 g
- Храните ДНК при 4°С или -20°С
Информация представлена исключительно в ознакомительных целях и ни при каких условиях не является публичной офертой