Инициаторные динуклеотиды лежат в основе элегантного метода синтеза длинных модифицированных молекул РНК исключительно ферментативными средствами[1]. Добавленные при in vitro транскрипции, инициаторные динуклеотиды эффективно включаются в 5' конец РНК-транскрипта. В результате в одношаговой ферментативной реакции могут быть получены 5'-модифицированные РНК размером до несколько kb [1,2]. Инициаторные динуклеотиды со свободной 5'-OH группой могут быть обработаны киназой и лигазой, в дальнейшем давая возможность для мечения или сборки более сложных РНК-комплексов (см. Рис.1) [2,3].
Рисунок 1: Многообразие использования инициаторных динуклеотидов в мечении РНК. И модифицированные и немодифицированные РНК динуклеотиды сайт-специфично встраиваются в процессе in vitro транскрипции. Получившиеся транскрипты могут быть затем подвергнуты 5'-фосфорилированию (также пригодны для радиоактивного мечения) и лигированию для получения внутренне-меченых РНК.
Jena Bioscience предлагает несколько видов инициаторных динуклеотидов для мечения РНК:
Источники: [1] Pitulle et al. (1992) Initiator oligonucleotides for the combination of chemical and enzymatic RNA synthesis. Gene 112 (1):101. [2] Sontheimer (1994) Site-specific RNA crosslinking with 4-thiouridine. Mol. Biol. Rep. 20:35. [3] Samanta et al. (2014) A modified dinucleotide for site-specific RNA-labelling by transcription priming and click chemistry Chem. Commun. 50:1313. Информация представлена исключительно в ознакомительных целях и ни при каких условиях не является публичной офертой |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||